MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechocystis sp. PCC 6803 substr. PCC-N

Total Repeats: 66795

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017052	GC	3	6	2	7	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_017052	GTG	2	6	68	73	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017052	GCG	2	6	88	93	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017052	TCT	2	6	167	172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017052	GGT	2	6	202	207	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017052	ATT	2	6	211	216	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017052	A	6	6	306	311	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017052	CT	3	6	328	333	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_017052	TG	4	8	385	392	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017052	ATC	2	6	393	398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_017052	CCGG	2	8	488	495	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_017052	AATT	2	8	567	574	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017052	GA	3	6	721	726	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017052	GTC	2	6	759	764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_017052	T	6	6	786	791	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017052	T	6	6	836	841	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017052	TGC	2	6	971	976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383489965
18	NC_017052	CCA	2	6	1026	1031	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383489965
19	NC_017052	GCG	2	6	1089	1094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383489965
20	NC_017052	C	6	6	1162	1167	0 %	0 %	0 %	100 %	383489965
21	NC_017052	TCC	2	6	1173	1178	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383489965
22	NC_017052	CCA	2	6	1202	1207	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383489965
23	NC_017052	CCCTA	2	10	1278	1287	20 %	20 %	0 %	60 %	383489965
24	NC_017052	CAG	2	6	1349	1354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383489965
25	NC_017052	GAA	2	6	1417	1422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383489965
26	NC_017052	A	6	6	1471	1476	100 %	0 %	0 %	0 %	383489965
27	NC_017052	CTCC	2	8	1501	1508	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
28	NC_017052	C	6	6	1507	1512	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
29	NC_017052	ATC	2	6	1565	1570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_017052	GCC	2	6	1613	1618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383489966
31	NC_017052	GAA	2	6	1619	1624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383489966
32	NC_017052	CAGG	2	8	1643	1650	25 %	0 %	50 %	25 %	383489966
33	NC_017052	TGG	2	6	1713	1718	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383489966
34	NC_017052	A	6	6	1724	1729	100 %	0 %	0 %	0 %	383489966
35	NC_017052	TCA	2	6	1806	1811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383489966
36	NC_017052	CCT	2	6	1867	1872	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383489966
37	NC_017052	GTG	2	6	1991	1996	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383489966
38	NC_017052	GGT	2	6	2000	2005	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383489966
39	NC_017052	AAC	2	6	2016	2021	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383489966
40	NC_017052	TTTG	2	8	2090	2097	0 %	75 %	25 %	0 %	383489966
41	NC_017052	GAA	2	6	2128	2133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017052	C	6	6	2228	2233	0 %	0 %	0 %	100 %	383489967
43	NC_017052	GTC	2	6	2378	2383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383489967
44	NC_017052	TGGAG	2	10	2411	2420	20 %	20 %	60 %	0 %	383489967
45	NC_017052	CCA	2	6	2421	2426	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383489967
46	NC_017052	AAT	2	6	2750	2755	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383489967
47	NC_017052	GCG	2	6	2797	2802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383489967
48	NC_017052	T	8	8	2817	2824	0 %	100 %	0 %	0 %	383489967
49	NC_017052	CAT	2	6	2831	2836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383489967
50	NC_017052	GTT	2	6	2840	2845	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383489967
51	NC_017052	TAT	2	6	2906	2911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017052	GCG	2	6	2923	2928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_017052	AC	3	6	2930	2935	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_017052	A	6	6	2940	2945	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017052	TTCA	2	8	3013	3020	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_017052	AGC	2	6	3048	3053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_017052	TCA	2	6	3233	3238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383489968
58	NC_017052	ATCG	2	8	3324	3331	25 %	25 %	25 %	25 %	383489968
59	NC_017052	GTT	2	6	3338	3343	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383489968
60	NC_017052	ATT	2	6	3387	3392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383489968
61	NC_017052	AAT	2	6	3402	3407	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383489968
62	NC_017052	TGG	2	6	3524	3529	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383489968
63	NC_017052	GAA	2	6	3546	3551	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383489968
64	NC_017052	AGGT	2	8	3751	3758	25 %	25 %	50 %	0 %	383489968
65	NC_017052	AAG	2	6	3784	3789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383489968
66	NC_017052	TTG	2	6	3853	3858	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383489968
67	NC_017052	CAA	2	6	3912	3917	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383489968
68	NC_017052	GGT	2	6	4170	4175	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383489968
69	NC_017052	TCA	2	6	4234	4239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383489968
70	NC_017052	GTT	2	6	4272	4277	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017052	CAAT	2	8	4303	4310	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_017052	G	7	7	4391	4397	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017052	TTG	2	6	4423	4428	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017052	AGT	2	6	4446	4451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383489969
75	NC_017052	GTT	2	6	4459	4464	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383489969
76	NC_017052	TGG	2	6	4543	4548	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383489969
77	NC_017052	AAT	2	6	4595	4600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383489969
78	NC_017052	TGG	2	6	4756	4761	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383489969
79	NC_017052	TCT	2	6	4869	4874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383489969
80	NC_017052	CAA	2	6	4949	4954	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383489969
81	NC_017052	TTC	2	6	4988	4993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383489969
82	NC_017052	TCT	2	6	5013	5018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383489969
83	NC_017052	CA	3	6	5066	5071	50 %	0 %	0 %	50 %	383489969
84	NC_017052	T	6	6	5078	5083	0 %	100 %	0 %	0 %	383489969
85	NC_017052	TGG	2	6	5094	5099	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383489969
86	NC_017052	CAT	2	6	5123	5128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383489969
87	NC_017052	C	6	6	5178	5183	0 %	0 %	0 %	100 %	383489969
88	NC_017052	AATT	2	8	5309	5316	50 %	50 %	0 %	0 %	383489969
89	NC_017052	CAA	2	6	5320	5325	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383489969
90	NC_017052	TGGT	2	8	5389	5396	0 %	50 %	50 %	0 %	383489969
91	NC_017052	AGGG	2	8	5415	5422	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017052	CCA	2	6	5456	5461	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_017052	GTT	2	6	5486	5491	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017052	CCA	2	6	5650	5655	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383489970
95	NC_017052	TAA	2	6	5732	5737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383489970
96	NC_017052	TCA	2	6	5766	5771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383489970
97	NC_017052	CCA	2	6	5857	5862	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383489970
98	NC_017052	CGG	2	6	6036	6041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383489970
99	NC_017052	G	6	6	6040	6045	0 %	0 %	100 %	0 %	383489970
100	NC_017052	GGT	2	6	6164	6169	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383489970
101	NC_017052	GAA	2	6	6210	6215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383489970
102	NC_017052	TCT	2	6	6387	6392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383489970
103	NC_017052	GCG	2	6	6398	6403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383489970
104	NC_017052	GTG	2	6	6408	6413	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383489970
105	NC_017052	GAT	2	6	6478	6483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383489970
106	NC_017052	ATG	2	6	6519	6524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383489970
107	NC_017052	CAA	3	9	6548	6556	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383489970
108	NC_017052	AAC	2	6	6602	6607	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383489970
109	NC_017052	A	6	6	6800	6805	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017052	ACTG	2	8	6868	6875	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
111	NC_017052	ATT	2	6	6924	6929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017052	ATT	2	6	6934	6939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017052	A	6	6	7068	7073	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017052	CAA	2	6	7300	7305	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383489971
115	NC_017052	GGTT	2	8	7319	7326	0 %	50 %	50 %	0 %	383489971
116	NC_017052	TGA	2	6	7335	7340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383489971
117	NC_017052	CCA	2	6	7359	7364	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383489971
118	NC_017052	TCA	2	6	7371	7376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383489971
119	NC_017052	CGC	2	6	7387	7392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383489971
120	NC_017052	C	6	6	7394	7399	0 %	0 %	0 %	100 %	383489971
121	NC_017052	AAC	2	6	7451	7456	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383489971
122	NC_017052	ATC	2	6	7457	7462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383489971
123	NC_017052	TGT	2	6	7471	7476	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383489971
124	NC_017052	CTT	2	6	7479	7484	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383489971
125	NC_017052	GGT	2	6	7553	7558	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383489971
126	NC_017052	GTA	2	6	7571	7576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383489971
127	NC_017052	GTC	2	6	7611	7616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383489971
128	NC_017052	TG	3	6	7658	7663	0 %	50 %	50 %	0 %	383489971
129	NC_017052	CCG	2	6	7692	7697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383489971
130	NC_017052	GGT	2	6	7847	7852	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383489971
131	NC_017052	CCT	3	9	7887	7895	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383489971
132	NC_017052	ACC	2	6	7907	7912	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383489971
133	NC_017052	AAG	3	9	7950	7958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383489971
134	NC_017052	ACA	2	6	7965	7970	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383489971
135	NC_017052	GCC	2	6	7976	7981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383489971
136	NC_017052	CTT	2	6	8016	8021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383489971
137	NC_017052	CAA	2	6	8023	8028	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383489971
138	NC_017052	CTT	3	9	8044	8052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383489971
139	NC_017052	TTCAAC	2	12	8126	8137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383489971
140	NC_017052	CTG	2	6	8295	8300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383489971
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142	NC_017052	G	6	6	8364	8369	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017052	TCT	2	6	8392	8397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_017052	ATCG	2	8	8418	8425	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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146	NC_017052	GAA	2	6	8498	8503	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383489972
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404	NC_017052	TAC	2	6	22287	22292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383489981
405	NC_017052	TCC	2	6	22300	22305	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383489981
406	NC_017052	C	6	6	22313	22318	0 %	0 %	0 %	100 %	383489981
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425	NC_017052	TACA	2	8	22881	22888	50 %	25 %	0 %	25 %	383489981
426	NC_017052	T	6	6	22918	22923	0 %	100 %	0 %	0 %	383489981
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432	NC_017052	ATTA	2	8	23134	23141	50 %	50 %	0 %	0 %	383489982
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435	NC_017052	CAA	2	6	23399	23404	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383489982
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453	NC_017052	ATA	2	6	24345	24350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383489983
454	NC_017052	ATT	2	6	24362	24367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383489983
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